перенести все скрипты из header в footer

А вы как их подключаете? просто пишете хтмл подключения в файл header.php или через функцию wp_enqueue_script?

Вы про скрипты? или какой код вставляю в файл?

А вы как их подключаете? просто пишете хтмл подключения в файл header.php или через функцию wp_enqueue_script?

про скрипты

Просто пишем, без функций

тогда файл footer.php, хотя по правильному подключать через функцию и в ней есть возможность указать, что скрпты выводить в футере:

wp_enqueue_script(
    'file-ID', // Ид файла, придумываем сами и пишем
    get_template_directory_uri() . '/file.js', // путь к файлу
    array('jquery'),// группа файла. для того, чтоб вордпресс вывел скрипты с jquery, оставьте как сейчас
    filemtime(get_template_directory() . '/file.js'), // путь к файлу в ОС, по которому берется время создания файла. нужно чтоб сбросить кеширование браузера при добавлении обновлении файла
    true // в этом месте знаечнием true указываем, что надо выводить в футере
);