Плагин Hyper Cache при запросе несуществующей страницы (404) для каждого уникального URL делает кэш. 200 таких кэшированных страниц съедают около 5 Мб на хосте. Пользуясь этой особенностью работы плагина можно "убить" все дисковое пространнство на хосте.
Написал о баге автору плагина.
Со стандартными ЧПУ все работает нормально, я так понял.